Осуществляется в соответствии с ст. 6.1 Закона РФ от 26 июня 1992 «О статусе судей в Российской Федерации». Председатель Высшего Арбитражного Суда РФ назначается на должность СФ сроком на 6 лет по представлению Президента РФ при наличии положительного заключения Высшей квалификационной коллегии судей РФ, которая представляет его Президенту РФ не позднее чем за 2 месяца до истечения срока полномочий Председателя Высшего Арбитражного Суда РФ, а в случае досрочного прекращения его полномочий – не позднее чем через 3 месяца со дня открытия вакансии.
Заместитель Председателя Высшего Арбитражного Суда РФ назначается на должность СФ сроком на 6 лет по представлению Президента РФ, основанному на представлении Председателя Высшего Арбитражного Суда РФ при наличии положительного заключения Высшей квалификационной коллегии судей РФ. Председатель Высшего Арбитражного Суда РФ вносит Президенту РФ указанное представление не позднее чем за 2 месяца до истечения срока полномочий заместителя Председателя Высшего Арбитражного Суда РФ, а в случае досрочного прекращения его полномочий – не позднее чем через 3 месяца со дня открытия вакансии. Президент РФ вносит в СФ представление о назначении Председателя Высшего Арбитражного Суда РФ, заместителя Председателя Высшего Арбитражного Суда РФ не позднее чем за 14 дней до истечения срока их полномочий, а в случае досрочного прекращения их полномочий – не позднее чем через 6 месяцев со дня открытия вакансии. СФ рассматривает вопрос о назначении на должность Председателя Высшего Арбитражного Суда РФ, заместителя Председателя Высшего Арбитражного Суда РФ в срок, не превышающий 14 дней после получения представления Президента РФ. Решение о назначении на должность Председателя Высшего Арбитражного Суда РФ, заместителя Председателя Высшего Арбитражного Суда РФ принимается большинством голосов от общего числа членов СФ и оформляется постановлением СФ.