Осуществляется на основании Федерального закона от 5 авг. 2000 «О порядке формирования Совета Федерации Федерального Собрания Российской Федерации», устанавливающего, что палата состоит из представителей, избранных законодательными (представительными) органами государственной власти субъектов РФ и назначенных высшими должностными лицами субъектов РФ (руководителями высших исполнительных органов государственной власти субъектов РФ) на срок их полномочий. Член СФ — представитель от двухпалатного законодательного (представительного) органа государственной власти субъекта РФ избирается поочередно от каждой палаты на половину срока полномочий соответствующей палаты. Кандидатура для избрания представителя в СФ от законодательного (представительного) органа государственной власти субъекта РФ вносится на рассмотрение этого органа его председателем, а от двухпалатного законодательного (представительного) органа государственной власти субъекта РФ — поочередно председателями этих палат. Решение законодательного (представительного) органа государственной власти субъекта РФ об избрании представителя в СФ принимается тайным голосованием и оформляется постановлением, а двухпалатного законодательного (представительного) органа государственной власти субъекта РФ — совместным постановлением обеих палат. Представитель в СФ от исполнительного органа государственной власти субъекта РФ назначается должностным лицом субъекта РФ (руководителем высшего исполнительного органа государственной власти субъекта РФ) на срок его полномочий. Решение высшего должностного лица субъекта РФ (руководителя высшего исполнительного органа государственной власти субъекта РФ) оформляется указом (постановлением), которое в 3-дневный срок направляется в законодательный (представительный) орган государственной власти субъекта РФ. Указ (постановление) вступает в силу, если на заседании законодательного (представительного) органа государственной власти субъекта РФ две трети от общего числа его депутатов не проголосуют против назначения данного представителя в СФ.
Орган государственной власти субъекта РФ, принявший решение об избрании (назначении) члена СФ, не позднее чем на следующий день после вступления решения в силу телеграммой уведомляет СФ о содержании решения и о дате его вступления в силу и не позднее 5 дней со дня вступления решения в силу направляет его в СФ.
Переходный период, в течение которого члены СФ, главы законодательных (представительных) и исполнительных органов государственной власти субъектов РФ, должны были сложить с себя полномочия, устанавливался не позднее 1 янв. 2002, когда, согласно федеральному закону, должно было завершиться полное обновление состава палаты.
Первое заседание СФ в составе, работающем полностью на постоянной основе, прошло 16 янв. 2002. 30 янв. 2002 СФ принял Регламент палаты, отражающий порядок формирования СФ, действующий в настоящее время, в котором детально определяются органы и порядок работы СФ, участие палаты в законодательной деятельности, порядок рассмотрения вопросов, отнесенных к ведению СФ, и др.