Назначается на должность СФ по представлению Президента РФ сроком на 6 лет. Кандидатуры для назначения на должность З. П. Счетной палаты РФ вносятся Президенту РФ Советом палаты по предложениям комитетов СФ. Президенту РФ вносятся не менее 3 кандидатур. Президент РФ выбирает из внесенных кандидатур одну и представляет ее в СФ для назначения на должность З. П. Счетной палаты РФ. В случае если ни одна из внесенных кандидатур не будет поддержана Президентом РФ, он вправе выдвинуть иную кандидатуру и представить ее в СФ для назначения на должность З. П. Счетной палаты РФ.
Решение СФ о назначении на должность З. П. принимается большинством голосов от общего числа членов СФ и оформляется постановлением СФ. З. П. может быть гражданин РФ, имеющий высшее профессиональное образование и опыт работы не менее 5 лет в области государственного управления, государственного контроля, экономики, финансов, юриспруденции. Он не может состоять в родственных отношениях с Президентом РФ, председателями СФ и ГД, Председателем Правительства РФ, Руководителем Администрации Президента РФ, Генеральным прокурором РФ, Председателем Следственного комитета РФ, председателями Конституционного Суда РФ, Верховного Суда РФ и Высшего Арбитражного Суда РФ. З. П. не может быть депутатом ГД, членом СФ, членом Правительства РФ, заниматься др. оплачиваемой деятельностью, кроме преподавательской, научной и иной творческой деятельности.
З. П. Счетной палаты РФ выполняет должностные обязанности в соответствии с Регламентом Счетной палаты РФ, исполняет в отсутствие Председателя Счетной палаты РФ его функции, по поручению Председателя Счетной палаты РФ представляет Счетную палату РФ внутри страны и за рубежом, имеет право принимать участие в заседаниях СФ и ГД, комитетов и комиссий палат, Правительства РФ, Президиума Правительства РФ.
З. П. обладает гарантиями профессиональной независимости. Он может быть досрочно освобожден от должности решением СФ в случаях, предусмотренных для досрочного освобождения аудиторов Счетной палаты РФ.
Решение о досрочном освобождении от должности З. П. Счетной палаты РФ оформляется постановлением СФ по представлению Президента РФ.